Oddělení chirurgie je umístěno v budově chirurgického monobloku (budova č. 23) vedle ředitelství KNTB. Lůžková část je ve 4. a 5. etáži, chirurgické ambulance ve 3. etáži.
Ambulance plastické chirurgie je umístěna v budově č. 6, vstup od očního oddělení.
Pacienti s náhlými akutními problémy jsou ošetřováni ve 23. budově na Oddělení urgentního příjmu KNTB.